Seminari õppetöö toimub tsükliõppena, kus auditoorne õpe toimub üldjuhul kord kuus kolmapäevast laupäevani ja oluline osa on tudengi iseseisval õppel.
1. Bakalaureuseõpe. Seminaris on võimalik õppida täiskoormusega, osakoormusega või eksternina.
- Täiskoormusega - üliõpilane täidab kumulatiivselt vähemalt 75 % (st. 45 EAP aastas) nominaalajaga õppekavast.
- Osakoormusega - üliõpilane täidab kumulatiivselt 50 kuni 74 protsenti (ehk 30-44 EAP õppeaastal) õppekavast.
- Eksternina - Eksternõpe on avatud neile, kellel on soov omandada teoloogiline haridus, aga puudub võimalus õppida täis- või osakoormusega. Eksternõppesse vastuvõtt toimub üliõpilastega samadel tingimustel. Eksternõppijal ei ole riikliku üliõpilase staatust, kuid tal on võimalus läbida õppekava oma tempos, sealhulgas sooritada ained ning kaitsta lõputöö. Ekstern osaleb õppetöös koos üliõpilastega ja läbib ained samadel tingimustel.
Nominaalne õppeaeg seminaris on kolm või neli aastat. Õpingute maht on 180 Euroopa ainepunkti (EAP, ing. k ECTS).
2. Mikrokraad. Mikrokraad on ühe õppeaasta pikkune fokusseeritud õppeprogramm, mis on loodud spetsiaalselt neile, kes soovivad süvendada oma teadmisi teoloogias või praktilises kristlikus teenimistöös, kuid kellel pole hetkel võimalust pühenduda täismahus bakalaureuseõppele.
Seminaris on 3 erinevat mikrokraadi programmi:
- Piibel ja teoloogia, 22 EAP
- Kristlik teenimistöö, 19 EP
- Metodistlik identiteet, ajalugu ja kirikukord, 14 EAP
3. Avatud kursused. Iga soovija võib osa võtta avatud kursustest. Pakutavate kursuste ja nende toimumisaegade kohta saab täpsemat infot täiendkoolitused lehelt.