Миссией Теологической Семинарии ЭМЦ является подготовка христианских работников и руководителей для церквей и христианских и благотворительных организаций, предлагая, согласно нуждам церкви и общества высшее теологическое образование и поддерживая в ходе процесса обучения духовное формирование.
Видением Семинарии является обеспечение соответствующего международным требованиям прикладного теологического образования и дополнительного обучения для христиан из Прибалтийских стран и стран близлежащих регионов.